自分の脳 MRI であそぼうのコーナー
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T1 像を MPRAGE で撮ってもらえるか?→撮ってもらえそう、面倒な注文つけてごめんね
やりたい
3Dプリント
Web アプリ
Tシャツ作成
とりあえず撮影したやつ見てみよう
MRIcroGL というので変換&開いてみる
https://gyazo.com/b7134f0195d7b73b6074e14429839583
急に知らない人出てくるの面白い
ダクソとかの中ザコくらいにいそう
ラボの後輩に脳だけ抽出してもらった(ありがとう)版
厳密にはアトラスのラベルを出してもらって、ラベルが無いところを消した
Python (+Medpy) でスッと .nii ファイルを読んだり書いたりできた
https://gyazo.com/f391b62177719307820240894fa684b3
この 3D 表示はボリュームレンダリング的なことをしているようで、内部にメッシュに変換していたりとかはやっていないようだ(残念)
メッシュ化するぞするぞ
NITRC(↑の MRIcroGL もここ?)が出してる Surfice というソフトウェアがあるらしいのでこれを試す
https://gyazo.com/a032d7a727c374577418c5ef1b5d7463
微妙なクオリティ
これ輝度値情報を使えばもっとスムーズにできたりしないか?
https://gyazo.com/eec11c8748e6fb28d9506e2609c18836
けっこうよくない!?
Surfice は明らかにマーチングキューブ法だったけど、これはどういうアルゴリズムなんだろう??
プリントするぞ~
https://gyazo.com/0d0e2bfa702796ae0a3b9ed8f866473a
eSUN の Silk PLA
なんかプリント途中で止まって上のほうがプリントされなかった
フィラメント切れやエラーなどではなく正常終了扱いに… なぜ
後輩氏 says:このアトラスは intracranial volume なので CSF を含んでいる。、脳実質を作るなら sulcus や ventricle は除いたほうがよいだろう
なるほど
https://gyazo.com/6ce40eaf4cc1356b2c6216ca0ca20f6c
たしかに溝がグッと深まったね
しかしこれ印刷できるのか…?
あまり深い溝があると3Dプリントが困難になる
マスクに対して軽めにクロージングを掛ければよいのではないか?
懐かしのscipy.ndimage氏を召喚
CSF は除いてプリント実行
失敗を恐れて、半球ずつ……
https://gyazo.com/5b307c91cb3fee4fae0cae28a4e405fe
サポートが多すぎる
https://gyazo.com/a032d7a727c374577418c5ef1b5d7463 https://gyazo.com/eec11c8748e6fb28d9506e2609c18836